《女神异闻录5》拥有多个结局，各自的达成条件如下：
没有按时打通迷宫，就会 Game Over，也算一种结局（有点牵强，就算 Game Over 了，也不能开启二周目）。真的想体验一下，也可以试试……
第六个迷宫 “新岛·殿堂” （10月底～11月中）打通后，系统提示接下来剧情有大变，建议存档。之后和新岛冴对话，相关选项如下：
| 顺序 | 问题 | 选项 |
| 1 | 要不要做个交易？ | 任选 |
| 2 | 他们都是怪盗团事件的共犯吧？ | 没错 |
| 3 | 能不能告诉我呢？（若问题2选择“没错”，则没有第3个问题，直接开始Bad Ending） | 全部说出来 |
如果按照上表，在第2、3个问题中选择对应选项，之后会出现提问“这么做是不是不对”，选择继续的话，就会到达 Bad Ending。
这是正经的结局，之后可以继承存档开启二周目。如果想体验这个结局，记得提前存档。
12月24日，在天鹅绒房间的剧情中，被问到 “那真的是正确的世界吗？”，如果选择：
“好吧…” → “似乎是个不错的提议…” ，则到达第二个 Bad Ending。
避开上述的 Bad Ending 选项，可以将故事继续下去，走向 Good Ending。比如在第一个 Bad Ending 的对话中，选择如下选项：
| 顺序 | 问题 | 选项 |
| 1 | 要不要做个交易？ | 任选 |
| 2 | 他们都是怪盗团事件的共犯吧？ | 不是 / 不知道 |
| 3 | 能不能告诉我呢？ | 没有合作者 |
之后的对话选择项不必在意，和 新島冴 随便聊吧。
从现在玩家的讨论结果来看，《女神异闻录5》没有真结局……
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